Возвращение домой обескураживает Кирка невероятными переменами, постигшими планету. Былой покой нарушен зловредным субъектом, бывшим коллегой, возжелавшим мстить Флоту. Недоброжелатель преследует участников формирования, чтобы однажды уничтожить слаженно нанесенным ударом. Некоторые друзья капитана оказываются жертвами атаки, устроенной изгоем. Желая реванша, смельчак затевает «Стартрек: Возмездие», чтобы положить конец земным страданиями. Командование запрещает яркому лидеру корабля бросаться вдогонку за отшельником, предостерегает от вмешательства в противостояние.

Отступник торжествует, а бравый предводитель экипажа звездолета не собирается бездействовать. Пока соперник набирает отряд последователей, готовых бесцеремонно расправляться с мирными жителями, преследователь клянется свергнуть безумца с трона победителя. Подопечные командира отчаянно пускаются в авантюрное странствие, чтобы предотвратить вылазку агрессивных войск. Сразу став опальными нарушителями приказов штаба, флотские служители не страшатся наказаний, ведь их цель — благородна и достойна риска. Храбрые лазутчики оказываются последним оплотом космического пространства, способным остановить будущего тирана перед захватом цивилизаций.