Таинственная организация осуществляет уникальную серию экспериментов, завязанных вокруг движущейся, практически живой конструкции с массой ловушек и минимумом шансов выжить. Надсмотрщик использует инструкции, выданные боссами и гениями инженерии, для смены локаций и задействования смертоносных механизмов. Жертвы помещаются в «Куб 3: Зеро» для прохождения цепочки испытаний. Обреченные заложники бродят по комнатам, пересекают отдельные дозволенные границы, но быстро теряют контроль над трансформирующейся субстанцией. Поиск секретного кода является основной целью пленников, но пока нет счастливчиков, вышедших наружу.

Охранник наблюдает за пытками пленников, но не имеет права сочувствовать незнакомцам. Строгое следование выданным распоряжениям предполагает полную отстраненность стражника от чужих страданий и мольб. Однажды молчаливый наблюдатель замечает, как в убийственную локацию вторгается безвинная женщина. Гнетущее чувство несправедливости поглощает мысли сотрудника корпорации. Маленькая пешка в руках манипулятора вскоре погибнет без права освобождения. Восстав против своеволия хитрых владельцев чудовищного изобретения, смельчак пытается вытащить бедняжку из западни. Только его вчерашние союзники намеренно уничтожают спасительные указатели, чтобы замести следы и проучить бунтаря.