Продвижение исследований образцов пришельцев, посягнувших на безопасность планеты, помогает землянам модернизировать защитные технологии. Знание устройства кораблей противника способствует внедрению учебных программ по нейтрализации инопланетных угроз. Человечество рискует проиграть следующий бой, ведь поверженная ранее сторона не дремлет, а готовит массированную атаку в «День независимости 2: Возрождение» для полного порабощения Земли. Армады армированных челноков нависают над практически беззащитными жертвами вторжения. Профессор, самоотверженно выстраивающий победный алгоритм противостояния осознает, что крепость земных машин ничтожна перед мощью завоевателей.

Мысленная подготовка к последствиям поражения мешает военным слаженно противостоять угрозе. Последним оплотом растерзанной страхами цивилизации становится летучий отряд спасателей. Вооруженные знаниями о слабостях недругов бойцы пытаются пробить брешь в главном судне налетчиков. Безуспешные попытки приближают падение слабой расы перед высокотехнологичными гостями. Существует минимальная вероятность перехитрить бдительность боевых установок, используя проверенный трюк. Рисковая команда готова сложить жизни ради проверки правильности расчетов математика.